Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLMPQ9H6B4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLMPQ9H6B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms