Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1DQ9H5J8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms