Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF3Q9H4W6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms