Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH19Q9H159 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH19Q9H159 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms