Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms