Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms