Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRCIN1Q9C0H9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCIN1Q9C0H9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms