Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM8Q9BZR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms