Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD2Q9BZL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD2Q9BZL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD2Q9BZL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms