Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TBC1D2Q9BYX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TBC1D2Q9BYX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TBC1D2Q9BYX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms