Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms