Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAPERQ9BY12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAPERQ9BY12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms