Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms