Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF7Q9BWX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms