Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf43Q9BWL3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf43Q9BWL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms