Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PBDC1Q9BVG4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms