Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PI4K2AQ9BTU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PI4K2AQ9BTU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PI4K2AQ9BTU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms