Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms