Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms