Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERPUD2Q9BSE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms