Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT3Q9BQG1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT3Q9BQG1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms