Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOSQ9BQE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOSQ9BQE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms