Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN18Q99952 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN18Q99952 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms