Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms