Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms