Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms