Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM209Q96SK2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms