Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8L2Q96SF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L2Q96SF2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L2Q96SF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms