Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UIMC1Q96RL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UIMC1Q96RL1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms