Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNT1Q96Q11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRNT1Q96Q11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRNT1Q96Q11 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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