Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC85AQ96PX6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85AQ96PX6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms