Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARAP1Q96P48 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms