Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf66Q96MD2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf66Q96MD2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms