Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms