Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP3Q96KP6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms