Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms