Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDLIM2Q96JY6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms