Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCHS1Q96JQ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms