Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAX2Q96IS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAX2Q96IS3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms