Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms