Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC12Q96GR4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC12Q96GR4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms