Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCD1Q96GM5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCD1Q96GM5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms