Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP36Q96EU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP36Q96EU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP36Q96EU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms