Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGF29Q96ES7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms