Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MALSU1Q96EH3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms