Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTP4Q96DX8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms