Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXPE2Q96DL1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 515.1 ms