Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN1Q96DB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms