Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.8 ms