Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM52Q96A61 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM52Q96A61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM52Q96A61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM52Q96A61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms